โจโจ้ ล่าข้ามศตวรรษ

คูโจ โจลีนถูกคนใส่ร้ายจนต้องกลายเป็นแพะรับบาปเข้าไปรับโทษในคุก ก่อนที่เธอจะปลุกพลังลี้ลับให้ตื่นขึ้น เมื่อสัมผัสที่จี้ซึ่งผู้เป็นบิดามอบให้

โจลีนเริ่มต้นชีวิตในเรือนจำ แต่แล้วสหายร่วมห้องขังที่คุ้มดีคุ้มร้ายก็ก่อเรื่องใหญ่ ด้วยการใช้จี้ของโจลีนปลุกพลังสแตนด์ของตนขึ้นมา

โจลีนโคจรมาพบกับเด็กหนุ่มท่าทางประหลาดที่เตือนไม่ให้เธอไปพบบุคคลที่นัดเยี่ยม แล้วคูโจ โจทาโร่ พ่อของเธอก็มาหาในวันต่อมา

โจทาโร่บอกกับโจลีนว่าสมุนเก่าของดีโอชื่อจอห์นกัลลี่ เอ. อยู่เบื้องหลังหลายๆ เรื่องที่เกิดขึ้น แต่โจลีนยังไม่ทันตอบโต้ สแตนด์ของจอห์นกัลลี่ เอ.ก็บุกมาเล่นงานทั้งคู่

โจทาโร่กับโจลีนตื่นขึ้นจากฝันที่สแตนด์ฝ่ายศัตรูบันดาลให้ทั้งคู่ พอหนีออกจากห้องเยี่ยมได้แล้ว ศัตรูใหม่ก็คืบคลานมาหาสองพ่อลูก

โจลีนตัดสินใจกลับไปในเรือนจำเพื่อชิงแผ่นดิสก์ของโจทาโร่ แล้วนักโทษชายท่าทางประหลาดก็ปรากฏต่อหน้าเออร์เมส คอสเตลโล่ ผู้เพิ่งปลุกสแตนด์ขึ้นมาอีกคน

เออร์เมสและโจลีนเข้าร่วมทีมตามหาผู้ต้องขังสองคนที่หายตัวไป เพราะหวังจะหาตำแหน่งแผ่นดิสก์ของไวท์สเนค ในระหว่างการค้นหานั้นเอง เออร์เมสก็จับสังเกตได้ว่ามีอะไรผิดปกติ

เออร์เมสและโจลีนประจันหน้ากับสแตนด์ที่จู่โจมทีมค้นหา นามว่าเอฟเอฟ ซึ่งถือกำเนิดจากแพลงก์ตอนที่ได้รับสติปัญญาจากไวท์สเนค

เอฟเอฟสวมรอยมาอยู่ใกล้ๆ โจลีนกับเออร์เมส โดยใช้รูปลักษณ์ของนักโทษที่ตายไป และในวันหนึ่งที่ทั้งสามกำลังเล่นแคทช์บอล นักโทษอีกคนก็เข้ามาหาพร้อมคำท้าพนัน

โจลีนต้องหนีให้พ้นการรักษาความปลอดภัย และนำแผ่นดิสก์สแตนด์ของโจทาโร่ไปให้มูลนิธิสปีดวากอน จากนั้นเอ็มโพริโอ้ก็โผล่มาพาเธอไปยังห้องปริศนา

โจลีนกับเวธเธอร์ รีพอร์ทถูกโจมตีโดยแลง แรงเลอร์ ศัตรูรายใหม่ซึ่งมีสแตนด์ที่ทำให้พวกเขาไร้น้ำหนัก และสร้างแรงสูบมรณะที่อันตรายถึงชีวิต

ก่อนจะไปถึงสวนกลางเรือนจำ โจลีนได้พบบาทหลวงพุชชี่ เธอขอร้องให้ปล่อยเธอไป ซึ่งเขาก็ตกลง แต่กลับส่งนักล่าอีกคนล่วงหน้ามาก่อนแล้ว

พอนึกได้ว่าไม่ได้เจอเออร์เมสมาหลายวัน โจลีนที่กำลังสงสัยก็สืบประวัติของเออร์เมส จนเจอข้อมูลที่บอกว่าอีกฝ่ายเข้ามาในเรือนจำด้วยจุดประสงค์บางอย่าง

เอฟเอฟและโจลีนคิดหาทางช่วยเออร์เมสสู้กับสปอร์ตแม็กซ์ แต่ทั้งสองก็ยังต้องต่อกรกับพลังสแตนด์ควบคุมคนตาย

โจลีนจงใจให้ตัวเองถูกส่งไปแดนอัลตร้าเซคิวริตี้เฮาส์ยูนิต เพราะหวังจะเจอกระดูก ขณะเดียวกัน เอฟเอฟก็ไปขอให้อนาซุยช่วย เพราะตั้งใจจะช่วยโจลีน

สแตนด์เซอร์ไวเวอร์จุดชนวนสงครามในแดนคุมประพฤติ ขณะที่โจลีนต่อสู้กับผู้คุมเรือนจำ เธอก็พบว่าเขาเป็นผู้ใช้สแตนด์เช่นเดียวกัน

โจลีนที่เป็นผู้ชนะออกตามหานักโทษที่ยังเหลือ ชายแก่มาหาเธอและบอกว่าตนคือผู้ใช้สแตนด์ที่ไวท์สเนคส่งมา

โจลีนเห็นว่าเอฟเอฟอยู่ในภาวะขาดน้ำขั้นวิกฤติระหว่างที่สู้กับเคนโซ จึงขอให้อนาซุยเข้าไปช่วย แต่เขากลับปฏิเสธ

โจลีนและพรรคพวกไล่ตามชายที่หนีไปพร้อมกระดูกจนทัน แต่ในทันใดนั้นทุกคนก็สังเกตกว่า มีต้นไม้ประหลาดงอกออกมาจากกองศพของนักโทษในบริเวณนั้น

โจลีนกับอนาซุยหนีไปตามหนองน้ำบนเรือที่โยโย มาเป็นคนบังคับ แต่แล้วโยโย มาก็หันมาเล่นงานพวกเขาด้วยพลังที่มองไม่เห็น

พอปะติดปะต่อสายสัมพันธ์ของบาทหลวงพุชชี่กับไวท์สเนคได้แล้ว เอฟเอฟต้องหาทางโค่นดี แอน จี ระหว่างนั้นไข่ที่โยโย มากลืนลงไป ฟักออกมาระหว่างที่ร่างนั้นกำลังแหลกสลาย

เวธเธอร์ รีพอร์ทเรียกฝนออกมาซึ่งช่วยปกป้องไม่ให้เอฟเอฟถูกทำลาย หลังจากนั้นพวกเขาได้กลับมาพบกับโจลีนและอนาซุย ทว่าทั้งกลุ่มกลับถูกโจมตี

โจลีนคิดหาทางหนีออกจากเกาะกรีนดอลฟิน และทำลายแผนการมักใหญ่ใฝ่สูงของบาทหลวงพุชชี่ แล้วผู้คุมนักโทษก็ส่งสารจากไวท์สเนคให้โจลีน

โจลีนที่อาศัยข้อความบนฝ่ามือนำทาง ต่อสู้กับความทรงจำอันเลือนรางของตน หนีทัพผู้คุม และไปถึงห้องลับที่ซ่อนอยู่...ตามที่มิวมิววางไว้

เหลือเวลาอีกเพียงห้าวันก็จะถึงคืนจันทร์ดับ บาทหลวงพุชชี่มุ่งหน้าไปทางทิศเหนือและพยายามเดินเกมเร็วเพื่อไม่ให้โจลีนตามทัน แต่แล้วเขาก็ถูกจับเป็นตัวประกันหน้าโรงพยาบาล

ขณะที่แยกย้ายกับเวธเธอร์ รีพอร์ท อนาซุยก็ต้องพยายามหาทางทวงคืนร่างกายของตน หลังจากที่โบฮีเมียน แรปโซดี สแตนด์ของศัตรูแยกร่างและวิญญาณของเขาออกจากกัน

ขณะที่โจลีนและพวกมุ่งหน้าไปยังแหลมคานาเวอรัลด้วยเฮลิคอปเตอร์ของโรมิโอ พวกเขาก็ถูกบางสิ่งโจมตีจนไม่สามารถลืมตาได้เลย

โจลีนได้รู้ความจริงที่น่าตกใจเกี่ยวกับเวธเธอร์ รีพอร์ทหลังปะทะกับริเคียล แล้วเธอกับเออร์เมสก็เจอหลุมที่ถูกขุดไว้ในโรงพยาบาล

ขณะที่ถูกสแตนด์ของเวอร์ซัสกักขังไว้ในความทรงจำเกี่ยวกับเหตุการณ์เครื่องบินตก โจลีนก็ดีดตัวออกจากเครื่องบินและเปิดฉากโจมตีศัตรู แต่ก็เวอร์ซัสกลับไม่ระคายเคืองเลยแม้แต้น้อย

เมื่อเวธเธอร์ รีพอร์ทฟื้นคืนความทรงจำ ความสามารถที่ทรงพลังอย่างเฮฟวี่เวธเธอร์ก็แผลงฤทธิ์โดยอัตโนมัติ ใครก็ตามที่ตกเป็นเหยื่อก็จะกลายสภาพเป็นหอยทากอย่างน่าอนาถ

คุณพ่อพุชชี่เกิดมาพร้อมพี่น้องฝาแฝด ซึ่งถูกสลับตัวกับเด็กน้อยอีกคนที่ประสบชะตากรรมอันน่าเศร้า และเมื่อเติบโตเป็นผู้ใหญ่ เขาได้พบชายปริศนานามว่าดีโอ

กลุ่มของโจลีนเร่งตามหาเวธเธอร์ รีพอร์ทและหยุดยั้งสแตนด์ของเขา ขณะเดียวกันเวธเธอร์ รีพอร์ทก็เดินหน้าคิดบัญชีกับบาทหลวงพุชชี่

เมื่อมีแผ่นดิสก์ที่บรรจุความสามารถของเวธเธอร์ รีพอร์ทอยู่ในมือ โจลีนและพวกพ้องก็มุ่งหน้าสู่แหลมคานาเวอรัลเพื่อตามล่าบาทหลวงพุชชี่ ที่เริ่มมีความเปลี่ยนแปลงทางร่างกาย

โจลีนพยายามต่อกรกับซีมูน สแตนด์ใหม่ของบาทหลวงพุชชี่ ที่เป็นส่วนผสมระหว่างไวท์สเนคและทารกสีเขียว ซึ่งมีความสามารถในการกลับด้านทุกสิ่งทุกอย่างที่สัมผัส

แม้ว่าโจลีนจะถูกโจมตีจนอวัยวะกลับด้าน บาทหลวงพุชชี่ก็ยังสัมผัสได้ว่าเธอยังไม่ตายและตัดสินใจย้อนกลับมาล่าตัวเธอ โดยหวังว่าเผด็จศึกตระกูลโจสตาร์ให้สิ้นซาก

หลังจากที่มีลำแสงพวยพุ่งออกมาจากร่างบาทหลวงพุชชี่ โจลีนและพวกก็ตื่นมาพบว่าบาทหลวงหายไปและแรงโน้มถ่วงก็กลับมาเป็นปกติ

โจลีนและพวกต้องรับมือกับเมดอินเฮฟเว่น สแตนด์ใหม่ของบาทหลวงพุชชี่ที่เคลื่อนไหวได้อย่างรวดเร็ว อนาซุยจึงต้องทำหน้าที่เป็นเหยื่อล่อ ในขณะที่โจทาโร่รอจังหวะโจมตี

เวลาที่เดินเร็วจนฉุดไม่อยู่ทำให้วัฏจักรของสรรพสิ่งหมุนเวียนกลับไปสู่จุดเริ่มต้น เอ็มโพริโอ้ตื่นขึ้นมาในเรือนจำกรีนดอลฟินสตรีท ขณะที่มนุษยชาติกำลังดำเนินชีวิตในโลกใบใหม่