สตาร์ วอร์ส: เดอะ โคลน วอร์ส

สาธารณรัฐจะต้องช่วยทายาทวัยหนุ่มทวงคืนอำนาจการควบคุมเมืองทะเลของเขาจากขบวนการแบ่งแยก วอร์ลอร์ดจอมชั่วร้ายที่หวังจะก่อสงครามกลางเมือง

เจไดและเจ้าชายมอนคาลาจะต้องหนีไปจนกว่ากำลังเสริมของกันแกนจากนาบูที่อยู่ใกล้เคียงจะมาถึง

เจ้าชายลี-ชาร์พยายามรวมคนของมอนคาลาให้เป็นหนึ่งเดียวเพื่อช่วยเจไดและทหารโคลนกำจัดผู้บุกรุกขบวนการแบ่งแยกไปจากโลกทะเล

จาร์ จาร์ บิงคส์จะต้องขึ้นเป็นผู้นำเพื่อหยุดไม่ให้กองทัพกันแกนไปเข้าร่วมพันธมิตรกับนายพลกรีวัส

ซีทรีพีโอและอาร์ทูดีทูสำรวจโลกใต้ดินสุดแปลกระหว่างที่ทำภารกิจเพื่อช่วยเหลือประชาชนแห่งอลีนที่ประสบภัยจากแผ่นดินไหว

หลังถูกแยกออกจากเจไดครูซเซอร์ อาร์ทูดีทูและซีทรีพีโอก็ได้พบกับประสบการณ์โชคร้ายสุดพิลึกมากมายบนโลกเอเลี่ยนสีสันสดใส

เร็กซ์และทหารโคลนถูกนายพลเครลล์ ผู้บัญชาการชั่วคราวชักจูงเข้าไปสู่ภารกิจท้าทายบนดาวมืด อัมบารา

นายพลเครลล์ออกคำสั่งให้กัปตันเร็กซ์และทหารโคลนแห่งกองพล 501 ไปยึดครองฐานทัพอากาศของอัมบาราที่ถูกคุ้มกันอย่างหนาแน่น และจะไม่ยอมรับสิ่งอื่นใดนอกจากชัยชนะ

ทหารโคลนกลุ่มหนึ่งขัดคำสั่งนายพลเครลล์เพื่อปฏิบัติการณ์ปลอมตัวเข้าไปคว้าชัยชนะ

เร็กซ์ต้องเลือกระหว่างการก่อกบฏต่อผู้บังคับบัญชาหรือปล่อยให้ลูกน้องสองคนถูกประหารโทษฐานขัดคำสั่ง

ประชาชนทั้งอาณานิคมบนดาวคีรอสหายตัวไป โอบีวัน อนาคิน และอาโซก้าพบว่าเป็นฝีมือของผู้ค้าทาสชาวซีเจอเรียน

อนาคินต่อสู้กับความรู้สึกตัวเองเมื่อเขา อาโซก้า โอบีวัน และเร็กซ์ต้องแฝงตัวเป็นผู้ค้าทาสซีเจอเรียนเพื่อหาตัวชาวอาณานิคมที่ถูกลักพาตัวไปจากคีรอส

ขณะที่อนาคินพยายามทำให้ราชินีแห่งซีเจอเรียนเชื่อว่าเธอเองก็ตกเป็นทาสเช่นกัน โอบีวันพยายามเคลื่อนตัวเข้าไปที่เหมืองของคาดาโว

อาโซก้าติดบ่วงไปกับสงครามอันตรายของลักซ์ บอนเทรีที่ต้องการทวงคืนความยุติธรรมให้กับการตายของแม่

โอบีวันปลอมตัวเป็นผู้ร้ายเพื่อหยุดยั้งแผนชั่วร้าย

โอบีวันที่ปลอมตัวอยู่ถูกไล่ล่าโดยอนาคินและอาโซก้า

โอบีวันที่ปลอมตัวอยู่เข้าร่วมการแข่งขันที่โหดร้ายกับพวกนักล่าเพื่อหาว่าใครคือที่หนึ่ง

ดูกูและนักล่าของเขาพยายามจะลักพาตัวสมุหนายกไป

เคานท์ดูกูต้องการชำระแค้นนารีมืด เขาปล่อยดรอยด์สังหารอย่างเต็มกำลังไปสู้อาซาจ เวนเทรสและญาตินักเวทย์ของเธอ

อาซาจ เวนเทรสที่ถูกทอดทิ้งอย่างไร้จุดหมายเข้าร่วมทีมนักล่าที่แข็งแกร่ง นำโดยโบบ้า เฟตต์ เพื่อทำภารกิจอันตรายที่ให้ค่าตอบแทนสูง

ซาเวจ โอเพรสยังคงตามหาพี่ชายที่หายสาบสูญของเขา ซิธลอร์ด ดาร์ธ มอล ผู้คาดว่าได้หลีกหนีความตาย

ซาเวจและดาร์ธ มอลร่วมมือกันเพื่อแก้แค้นโอบีวัน ทำให้เจไดต้องร่วมทีมกับผู้ที่คาดไม่ถึง