สตาร์ วอร์ส: เดอะ โคลน วอร์ส

ห้านักเรียนทหารสุดดื้อรั้น เฮวี่ คัตอัป ดรอยด์เบต ไฟวส์และเอดโค่มีปัญหากับการฝึกซ้อมบนดาวคามิโน่ เพราะไม่สามารถทำงานเป็นทีมได้ พวกเขาจึงต้องยอมรับอนาคตของพวกเขาในฐานะทหาร

เมื่อสาธารณรัฐรู้แผนการโจมตีคามิโน่ของขบวนการแบ่งแยก อนาคินและโอบีวันจึงรีบไปป้องกัน เวนเทรส นายพลกรีวัส และกองทัพดรอยด์เผยตัวขึ้นมาจากทะเลของคามิโน่ เพื่อทำลายฐานผลิตโคลน

รีลอธกำลังถูกล้อม ขณะติดอยู่บนพื้นผิว อาจารย์เจไดดี รวบรวมกองกำลังท้องถิ่นโดยได้ความช่วยเหลือจากหัวหน้าฝ่ายต่อต้านอย่างแชม ซินดุลล่า

เมื่อครอบครัวของประธานปาปานอยด้าถูกลักพาตัวไปเพื่อเรียกค่าไถ่ อาโซก้า ทาโน่จะต้องร่วมทีมกับสมาชิกวุฒิสภาจากแพนทอรันอย่างริโย ชูชิเพื่อช่วยประธานคนใหม่เอาครอบครัวของเขากลับคืนมา

แพดเม่ไปเยือนแมนดาลอร์เพื่อภารกิจด้านการฑูต เธอกลับต้องไปสืบเรื่องการระบาดของโรคที่โรงเรียนกับดัชเชสซาทีน

ด้วยความคับแค้นใจ อาโซก้า ทาโน่ถูกมอบหมายให้ไปสอนที่โรงเรียนทหารบนแมนดาลอร์ แต่หลังมาถึงไม่นาน นักเรียนบางคน รวมถึงหลานของดัชเชสซาทีนถูงดึงให้ไปร่วมในแผนการชั่วร้าย

ขณะปฏิบัติหน้าที่คุ้มกันสมาชิกวุฒิสภาแพดเม่ อมิดาล่าระหว่างภารกิจทางการเมืองที่อัลเดอราน อาโซก้า ทาโน่ต้องทรมานกับภาพนิมิตของออร่า ซิง นักล่าที่สันนิษฐานว่าตายไปแล้ว

ระหว่างทริปช้อปปิ้งบนคอรัสซอง ซีทรีพีโอถูกแคดเบนจับตัวไป ไม่นานนัก ทั้งซีทรีพีโอและอาร์ทูดีทูพบว่าพวกเขาเป็นส่วนหนึ่งของแผนที่พาซีโร่เดอะฮัตต์หนีออกจากคุกใจกลางสาธารณรัฐที่มีการคุ้มกันแน่นหนา

หลังได้รับการปล่อยตัวจากคุกสาธารณรัฐโดยนักล่าแคดเบน ซีโร่เดอะฮัตต์ค้นพบว่าเขาถูกสภาฮัตต์ตามตัวอยู่

ระหว่างที่ในวุฒิสภานั้นยุ่งวุ่นวายอยู่กับการถกเถียงเรื่องงบประมาณและร่างกฎหมาย แพดเม่ อมิดาล่าและอาโซก้า ทาโน่แอบเดินทางไปแร็กซัสเพื่อทำสัญญาสันติภาพกับขบวนการแบ่งแยก

สมาชิกวุฒิสภาแพดเม่ อมิดาล่า เบล ออร์กาน่าและโอนาคอนด้า ฟาร์รวบรวมรายชื่อสมาชิกคัดค้านกฎหมายอนุมัติงบประมาณสร้างกองทัพโคลนหลายล้านกองทัพเพื่อไม่ให้เกิดผลเสียต่อการคลังของสาธารณรัฐ

ความวุ่นวายที่เพิ่มมากขึ้นเพราะความองอาจต่อพลังจากด้านมืดของอาซาจ เวนเทรสทำให้ดาร์ธ ซีเดียสสั่งให้เคานท์ดูกูกำจัดเธอทิ้งซะ

เคานท์ดูกูไปพบนารีมืดเพื่อมองหาลูกศิษย์คนใหม่ที่จะมาแทนอาซาจ เวนเทรส

เคานท์ดูกูฝึกฝนซาเวจ โอเพรสให้ก้าวสู่ด้านมืด โอบีวันและอนาคินเดินทางไปยังดาโธเมียเพื่อเรียนรู้เรื่องนักฆ่าเจไดเผ่าพันธุ์ซาแบรกคนนี้ให้มากขึ้น

พลังลึกลับดึงดูดอนาคิน โอบีวัน และอาโซก้าไปยังดาวอันห่างไกลเพื่อพิสูจน์ว่าอนาคินคือผู้ถูกเลือกที่แท้จริงหรือไม่

ก่อนที่เหล่าเจไดจะออกมาจากมอร์ทิสได้ อาโซก้า ทาโน่ถูกจับตัวไปเพื่อชักจูงให้อนาคิน สกายวอล์คเกอร์เข้าร่วมด้านมืด

เหล่าเจไดถูกทิ้งไว้บนมอร์ทิส ขณะที่อนาคิน สกายวอล์คเกอร์ติดอยู่ระหว่างด้านมืดและด้านสว่างของพลัง เมื่อเหล่าเจไดเตรียมเผชิญหน้า อนาคินจะต้องพบกับภาพที่น่าตกใจเกี่ยวกับอนาคตของเขา

หน่วยกู้ภัยชั้นยอด นำทีมโดยโอบีวัน เคโนบีและอนาคิน สกายวอล์คเกอร์พยายามช่วยนายพลเจไดจากคุกอันหนาแน่นของขบวนการแบ่งแยก

หลังปลดปล่อยนักโทษสำเร็จ โอบีวัน เคโนบีและอนาคิน สกายวอล์คเกอร์ตามหาทางออกจากคุกซีต้าเดล

หลังยานของพวกเขาถูกทำลาย อนาคิน สกายวอล์คเกอร์และโอบีวัน เคโนบีจะต้องหาวิธีหนีออกจากซีต้าเดลใหม่

อาโซก้า ทาโน่และเด็กๆ กลุ่มหนึ่งที่ถูกลักพาตัวมาถูกทิ้งไว้บนวาสคา และต้องหนีจากกลุ่มนักล่าโหดเหี้ยมจากแทรนโดชาน

ขณะที่อาโซก้า ทาโน่และเด็กๆ ดิ้นรนหนีการจับกุมจากกลุ่มนักล่าแห่งแทรนโดชาน พวกเขาก็ได้รับการสนับสนุนจากเพื่อนนักโทษที่ไม่ได้คาดคิดไว้