ไยบะ เจ้าหนูซามูไร

ไยบะ เด็กหนุ่มที่อยากเป็นซามูไร ฝึกวิชาในป่ากับเค็นจูโร่ผู้เป็นพ่อและเสือเพื่อนรัก ก่อนจะจับพลัดจับผลูมาอยู่ที่ญี่ปุ่นและไปพักอยู่กับเพื่อนของเค็นจูโร่

ไยบะพยายามรังควานโอนิมารู เพื่อหลอกล่อให้เขาต่อสู้ โอนิมารูปฏิเสธที่จะสู้ จนกระทั่งโชโนะสุเกะเข้าไปทลายกรงพิราบสุดรักของเขา

หลังพ่ายแพ้ต่อโอนิมารู ไยบะก็มุ่งมั่นที่จะทำให้ตัวเองแข็งแกร่งขึ้น และมุ่งหน้าขึ้นภูเขาเพื่อหวังจะคว้าดาบวิเศษมาเป็นของตัวเอง

โอนิมารูเรียกเหล่าปีศาจมาช่วยตามล่าดาบเทพอสนี ขณะเดียวกัน ไยบะเริ่มฝึกกับมุซาชิ เพื่อใช้ดาบทรงพลังเล่มใหม่ของตนให้ช่ำชอง

ไยบะและคนอื่นๆ มุ่งหน้าไปยังเกาะกังริว เพื่อค้นหาดาบของซาซากิ โคจิโร่ หลังจากจัดการกับปีศาจรูปร่างคล้ายหอยทากแล้ว พวกเขาก็หยุดแวะที่รีสอร์ทน้ำพุร้อน

ขณะอยู่ที่นาโกย่า ไยบะและผองเพื่อนเจอกับคู่ต่อสู้ที่ทรงพลังอย่างแบ็ทกาย ที่ต้องการชิงดาบเทพอสนี ในระหว่างที่ปะทะกันอยู่นั้น แบ็ทกายก็กัดเข้าที่คอของมุซาชิ

ไยบะและพวกพ้องมาถึงเกาะกันริวจิมะและได้พบท่านโอนิมารูและซาซากิ โคจิโร่ที่ฟื้นคืนชีพขึ้นมา… แต่ดูท่าจะไม่ค่อยพอใจเท่าไหร่

การต่อสู้ระหว่างมูซาชิและโคจิโร่ดำเนินต่อไปตามที่บันทึกไว้ เพื่อให้ไยบะกลับไปยังเวลาช่วงเดิมได้ แต่คำพูดแบบไม่คิดหน้าคิดหลังของไยบะ อาจเป็นชนวนพลิกประวัติศาสตร์

ไยบะเข้ารับการฝึกฝนอย่างหนักกับมุซาชิอีกครั้ง เพื่อพัฒนาวิชาดาบใหม่มาต่อกรกับโอนิมารู โดยมีโคจิโร่คอยวางแผนอยู่เบื้องหลัง

ไยบะและพรรคพวกบุกปราสาทโอนิมารู แต่กลับตกลงไปในหลุมกับดักที่ส่วนลึกของปราการ จากนั้นก็ต้องสู้กับสมุนกลุ่มใหม่ของโอนิมารู

ขณะที่ต่อสู้กับโอนิมารู ไยบะปลดปล่อยพลังแห่งดาบด้วยลูกแก้วเทพอสนี ศึกในตำนานระหว่างดาบเทพอสนีและดาบเทพวายุจึงอุบัติขึ้น

ขณะที่ไยบะไม่อยู่ เด็กสาวที่ตระเวนไปท้าประลองกับนักสู้ตามสำนักต่างๆ ก็มาเยือนโรงฝึกมิเนะ และอ้างว่าไยบะคือคู่หมั้นของเธอ

ขณะที่ไยบะและพวกมุ่งหน้าไปยังทะเลสาบบิวะ เพื่อค้นหาลูกแก้วเทพมังกร โอนิมารูก็เรียกนักดาบผู้ยิ่งใหญ่จากอดีต ให้ไปโจมตีไยบะ

ไยบะและผองเพื่อนเดินทางมาถึงเกาะชิโกกุ เพื่อตามหาลูกแก้วลูกต่อไป แต่แล้วก็เกิดการปะทะกับนินจาฝีมือฉกาจ ส่วนโอนิมารูเตรียมยึดครองญี่ปุ่น

ไยบะและผองเพื่อนเจอเข้ากับมนุษย์ปลาดาวที่คิวชู ซึ่งเป็นผู้นำทางทุกคนไปตามหาลูกแก้วลูกต่อไปที่ภูเขาอาโสะ โดยมีมนุษย์แมงมุมและชิโร่ อาระวารุสะกดรอยตามไป

ขณะที่รอข้อมูลจากนาเดชิโกะ ไยบะและพวกพ้องก็มาถึงนารา และได้พบกับนักรบ ซึ่งมาขอเป็นสมาชิกกลุ่ม

ก่อนการต่อสู้เพื่อชิงลูกแก้วกลับคืนมา ไยบะและเหล่าสหายเจอนักดาบไร้เทียมทาน ที่อ้างตัวเป็นลูกศิษย์ของมุซาชิ

ไยบะและคนอื่นๆ เดินทางมาที่เกาะคาวานากะพร้อมเพื่อนใหม่ เพื่อต่อสู้กับโกเอมอนอีกครั้ง แต่จู่ๆ ก็ถูกกองทัพนินจารุมล้อม

เกโรคิจิบอกว่ามีทางออกจากแดนแห่งความมืดอยู่หลังน้ำตก ไยบะและจูเบจึงมุ่งหน้าไปที่นั่น แต่กลับพบกัปปะผู้น่าเกรงขามยืนเฝ้าอยู่

ไยบะและผองเพื่อนเดินทางมาตามหาลูกแก้วลูกที่เจ็ดที่วัดในอาโอโมริ ขณะที่ลูกแก้วดวงอื่นๆ เริ่มเรืองแสง ชายชราลึกลับท่าทางน่ากลัวก็ปรากฏตัวขึ้น

ไยบะและพวกพ้องใช้ลูกแก้วรู้แจ้งนำทาง เพื่อค้นหาลูกแก้วเทพมังกรที่ซ่อนอยู่บนภูเขาไฟฟูจิ ขณะที่จ้าวจอมมารโอนิมารูกำลังรอพวกเขาอยู่ที่นั่น

แม้จะต้องเสียศูนย์จากการสูญเสียพวกพ้อง ไยบะและคนอื่นๆ ก็ยังเดินหน้าฝ่าด่านทดสอบของเทพมังกร ซึ่งแต่ละด่านก็ยากเย็นมากขึ้นเรื่อยๆ

ไยบะเผชิญการตัดสินใจที่ยากลำบากในด่านทดสอบสุดท้ายของเทพมังกร เมื่อเขาต้องเลือกว่าจะสละชีวิตพวกพ้องเพื่อครอบครองลูกแก้วเทพมังกร หรือยอมทิ้งลูกแก้วเพื่อรักษาชีวิตพวกพ้อง

การต่อสู้ระหว่างไยบะและโอนิมารูต้องชะงัก เมื่อเรือเหาะลำยักษ์ปรากฏขึ้น พร้อมหญิงสาวผู้น่าเกรงขามนามว่าคายูงะ ซึ่งเป็นราชินีปกครองดวงจันทร์